Из теней Нью-Йорка поднимается тёмная сила. Однако в ответ в поисках мести возвращается некто пострашнее: Шреддер — изменившийся после мучительного испытания, всеми преданный, лишённый клана «Фут» и, быть может, рассудка. Столкнувшись с бывшим учеником, что создаёт собственный клан с кошмарными планами на Нью-Йорк, Шреддер отправляется в преступный мир, где старые и новые враги столкнутся с его смертоносными клинками.